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技能包 · v0.6.47

dsh-bio-genie

github.com/moonbowterfly/dsh-bio-genie

能力可执行外部程序写入文件发起网络请求

下载安装即用 —— 无需用户安装 Python 或 Biopython,插件首次运行自动引导完全隔离的 Python 环境。

作者原文(英文)

生物信息学「许愿式分析」插件:Python 执行器(bio_python:Biopython 全功能 + 出版级绘图)+ 57 个高频语义化工具(差异表达/GSEA、代谢建模/FBA、合成生物学设计、CRISPR、ML、文献检索、Addgene 质粒库、UniProt、单细胞 QC 等)+ 50 个 skill(1 主 skill + 17 领域配方 + 19 协议 + 5 研究方法 + 8 agent 指南)+ 零依赖自举 Python 环境(uv+venv 自动下载到插件私有目录)。用户下载安装即可许

简介取自插件自己的 README 原文。

dshdeepseek-harnessdsh-pluginbioinformaticsbiologybio-analysisbiology-analysisbiopython
认证 L1已扫描 ✓健康 S/95周下载 758
7 项能力
许可
MIT
发布
2026-10-07
维护者
moonbowterfly
插件 ID
529

安装命令

dsh plugin --profile web add @dsh-bio/dsh-bio-genie@0.6.47

试装需批准构建脚本

安装过程会执行依赖的构建脚本,pnpm 默认拒绝执行这类脚本,需要人工批准后才能继续。本站不在无人值守的检查里替你批准。

检测报告

关注度高。命中了不少能力模式,其中可能有需要留意的。逐条看下面的清单。
1高关注3需留意3一般17未命中
高关注需留意一般

能力清单

  • 可执行外部程序spawns-processes高关注3 处命中
    • src/python.js:12import { spawn } from 'node:child_process'
    • src/runtime.js:18import { spawn, spawnSync } from 'node:child_process'
    • src/server.js:23import { spawn } from 'node:child_process'
    • 看它调用哪些程序。调用本机已有的工具是常见做法。
  • 写入文件writes-files需留意31 处命中
    • scripts/install-preset.js:51mkdirSync(dst, { recursive: true })
    • scripts/install-preset.js:69copyFileSync(s, d)
    • scripts/install-preset.js:105mkdirSync(targetRoot, { recursive: true })
    • src/log.js:54unlinkSync(p)
    • 看写入位置。写自己的配置目录是正常的,写系统目录不是。
  • 发起网络请求network需留意9 处命中
    • lib/client.js:23* - 浏览器 fetch('/api/dsh-bio-genie/<endpoint>') 同源调宿主侧 server.js 注册的路由
    • lib/client.js:195return fetch(RPC_PREFIX + path, {
    • lib/client.js:583return fetch(RPC_PREFIX + path, {
    • lib/client.js:3217? (sizeMismatch ? ('图片尺寸与 manifest/hitmap 不配对(实际 ' + fmtAny(sizeMismatch.got.w) + 'x' + fmtAny(sizeMismatch.got.h) + ',期…
    • 看请求发往哪些域名。发往作者自己的后端是常见做法。
  • R013 清单可疑manifest-obfuscation需留意1 处命中
    • 安装脚本: postinstall
    • 清单被刻意写乱时,加载行为会难以预测。看原文而不是看渲染结果。
  • 读取文件reads-files一般63 处命中
    • src/domain-adapter.js:126const readPkg = (p) => JSON.parse(readFileSync(p, 'utf8'))
    • src/domain-overview.js:11const HOST_VERSION = JSON.parse(readFileSync(new URL('../package.json', import.meta.url), 'utf8')).version
    • scripts/install-preset.js:52for (const entry of readdirSync(src, { withFileTypes: true })) {
    • scripts/install-preset.js:60if (existsSync(d) && skipExisting) {
    • 读文件是绝大多数插件的正常工作方式,本身不构成顾虑。
  • 读取环境变量reads-env一般25 处命中
    • scripts/install-preset.js:34if (process.env.DSH_HOME && process.env.DSH_HOME.length > 0) return process.env.DSH_HOME
    • scripts/install-preset.js:36const userHome = process.env.USERPROFILE || process.env.HOME || homedir()
    • src/python.js:22const dshHome = process.env.DSH_HOME ?? join(homedir(), '.dsh')
    • src/python.js:38env: { ...process.env, PYTHONPATH: '', PYTHONHOME: '', DSH_BIO_FIGORIGIN: figoriginMode() },
    • 环境变量里常混有密钥。看它是否把整个 env 都读走。
  • 动态加载模块dynamic-import一般8 处命中
    • README.en.md:303node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"
    • README.md:344node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"
    • python/bio_ops.py:33from synbio_tools import (op_primer3_design, op_dna_optimize, op_clone_simulate,
    • python/bio_ops.py:42from analysis_ext import (op_seq_introns, op_seq_dotplot, op_uniprot,
    • 动态导入本身无害,但会让依赖关系难以静态审阅。
逐条扫描明细
能力标识关注度命中次数
可执行外部程序spawns-processes高关注3
写入文件writes-files需留意31
发起网络请求network需留意9
R013 清单可疑manifest-obfuscation需留意1
读取文件reads-files一般63
读取环境变量reads-env一般25
动态加载模块dynamic-import一般8

这份报告的口径

扫描读的是包里的源码,全程不执行第三方代码。 本次读了 137 个文件,扫描于 2026-10-15。 命中次数只说明源码里出现过这类调用,不说明行为好坏——一个插件读写文件 500 次和 1 次 都会被记为「读取文件」。这是能力清单,不是信任评分,也不是安全结论: 没扫出来的能力可能只是写法没被规则覆盖。

可信度

95 健康分 S 扣分项下方逐条附证据
  • -5需要批准构建脚本才能装(本站不代跑第三方代码)warn

认证等级 L1

  • L0静态结构与契约✓sha512-slL2waexj+sUmYB4… 与本地 tarball 复算一致,补丁与入口齐备
  • L1配置组合与依赖图✓跨包无 entry id 冲突,插入模块可解析,目录内 peer 满足
  • L2隔离沙箱冒烟—需要批准构建脚本——本站不代跑第三方代码
  • L3运行时健康监控—未抽样(本层是抽样检测:没有会话不等于干净)
评分口径与作者信息

从 100 分开始按规则扣减:fail −20 / major −10 / warn −5 / minor −2;star 数、下载量、LLM 输出都不参与评分

维护者
moonbowterfly
仓库
https://github.com/moonbowterfly/dsh-bio-genie
许可
MIT
最后发布
2026-10-07
周下载
758
star
2

扫描状态:已扫描。能力是事实,不是缺陷; 周下载与 star 只作参考,不参与评分。

认证等级只回答四件事:包本身是否完整可解析(L0)、能不能与别的插件组合(L1)、隔离环境里装不装得上并起得来(L2)、抽样运行时有没有异常(L3)。依赖漏洞、仓库存活、下载量都不参与评级,只作为独立信号标注。可信 ≠ 无漏洞,上架 ≠ 推荐。

DSH peer 依赖3 个dsh-skilldsh-system-promptdsh-tools均为 @deepseek-ai/ 下的包
Node 要求^22.19 || >=24
第三方依赖0 个(纯自包含)
bundle patch./cordis.patch.yml
依赖安全公告已查询全部依赖,没有匹配到已公开的安全公告(含 DSH 框架包在内的 @deepseek-ai/* 不作查询——那是运行时自己的问题,不是插件的。)

元数据

仓库最近提交2026-10-14
仓库创建2026-08-15

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