dsh-bio-genie
github.com/moonbowterfly/dsh-bio-genie
v0.6.47
技能包
可执行外部程序写入文件发起网络请求
生物信息学「许愿式分析」插件:Python 执行器(bio_python:Biopython 全功能 + 出版级绘图)+ 57 个高频语义化工具(差异表达/GSEA、代谢建模/FBA、合成生物学设计、CRISPR、ML、文献检索、Addgene 质粒库、UniProt、单细胞 QC 等)+ 50 个 skill(1 主 skill + 17 领域配方 + 19 协议 + 5 研究方法 + 8 agent 指南)+ 零依赖自举 Python 环境(uv+venv 自动下载到插件私有目录)。用户下载安装即可许
该插件尚未翻译,显示作者原文。
dshdeepseek-harnessdsh-pluginbioinformaticsbiologybio-analysisbiology-analysisbiopython
检测报告
关注度高。命中了不少能力模式,其中可能有需要留意的。逐条看下面的清单。
1高关注3需留意4一般16未命中
高关注需留意一般
能力清单
- 可执行外部程序
spawns-processes高关注3 处命中src/python.js:12import { spawn } from 'node:child_process'src/runtime.js:18import { spawn, spawnSync } from 'node:child_process'src/server.js:23import { spawn } from 'node:child_process'- 看它调用哪些程序。调用本机已有的工具是常见做法。
- 写入文件
writes-files需留意31 处命中scripts/install-preset.js:51mkdirSync(dst, { recursive: true })scripts/install-preset.js:69copyFileSync(s, d)scripts/install-preset.js:105mkdirSync(targetRoot, { recursive: true })src/log.js:54unlinkSync(p)- 看写入位置。写自己的配置目录是正常的,写系统目录不是。
- 发起网络请求
network需留意9 处命中lib/client.js:23* - 浏览器 fetch('/api/dsh-bio-genie/<endpoint>') 同源调宿主侧 server.js 注册的路由lib/client.js:195return fetch(RPC_PREFIX + path, {lib/client.js:583return fetch(RPC_PREFIX + path, {lib/client.js:3217? (sizeMismatch ? ('图片尺寸与 manifest/hitmap 不配对(实际 ' + fmtAny(sizeMismatch.got.w) + 'x' + fmtAny(sizeMismatch.got.h) + ',期…- 看请求发往哪些域名。发往作者自己的后端是常见做法。
- R013 清单可疑
manifest-obfuscation需留意1 处命中- 安装脚本: postinstall
- 清单被刻意写乱时,加载行为会难以预测。看原文而不是看渲染结果。
- 读取文件
reads-files一般63 处命中src/domain-adapter.js:126const readPkg = (p) => JSON.parse(readFileSync(p, 'utf8'))src/domain-overview.js:11const HOST_VERSION = JSON.parse(readFileSync(new URL('../package.json', import.meta.url), 'utf8')).versionscripts/install-preset.js:52for (const entry of readdirSync(src, { withFileTypes: true })) {scripts/install-preset.js:60if (existsSync(d) && skipExisting) {- 读文件是绝大多数插件的正常工作方式,本身不构成顾虑。
- 读取环境变量
reads-env一般25 处命中scripts/install-preset.js:34if (process.env.DSH_HOME && process.env.DSH_HOME.length > 0) return process.env.DSH_HOMEscripts/install-preset.js:36const userHome = process.env.USERPROFILE || process.env.HOME || homedir()src/python.js:22const dshHome = process.env.DSH_HOME ?? join(homedir(), '.dsh')src/python.js:38env: { ...process.env, PYTHONPATH: '', PYTHONHOME: '', DSH_BIO_FIGORIGIN: figoriginMode() },- 环境变量里常混有密钥。看它是否把整个 env 都读走。
- 接触凭据或密钥
credentials一般10 处命中lib/client.js:197credentials: 'same-origin',lib/client.js:585credentials: 'same-origin',src/domain-adapter.js:34'gem_secretion', 'gem_double_knockout', 'gem_enrichment', 'gem_targets', 'gem_precursor_scan',…e/skills/dsh-bio-genie-expert.md:143| 必需基因全扫 / 通量区间(硬结论 vs 伪影)/ 鲁棒性 / 双敲 SL / 分泌谱 / 富集 / 靶点导出 | `gem_essentiality` / `gem_fluxscan` / `gem_sensitivity` / `g…- 看它读取哪些凭据、发往哪里。用于登录自己的服务是正常的。
- 动态加载模块
dynamic-import一般8 处命中README.en.md:303node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"README.md:344node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"python/bio_ops.py:33from synbio_tools import (op_primer3_design, op_dna_optimize, op_clone_simulate,python/bio_ops.py:42from analysis_ext import (op_seq_introns, op_seq_dotplot, op_uniprot,- 动态导入本身无害,但会让依赖关系难以静态审阅。
逐条扫描明细
| 能力 | 标识 | 关注度 | 命中次数 |
|---|---|---|---|
| 可执行外部程序 | spawns-processes | 高关注 | 3 |
| 写入文件 | writes-files | 需留意 | 31 |
| 发起网络请求 | network | 需留意 | 9 |
| R013 清单可疑 | manifest-obfuscation | 需留意 | 1 |
| 读取文件 | reads-files | 一般 | 63 |
| 读取环境变量 | reads-env | 一般 | 25 |
| 接触凭据或密钥 | credentials | 一般 | 10 |
| 动态加载模块 | dynamic-import | 一般 | 8 |
这份报告的口径
扫描读的是包里的源码,全程不执行第三方代码。 本次读了 137 个文件,扫描于 2026-10-14。 命中次数只说明源码里出现过这类调用,不说明行为好坏——一个插件读写文件 500 次和 1 次 都会被记为「读取文件」。这是能力清单,不是信任评分,也不是安全结论: 没扫出来的能力可能只是写法没被规则覆盖。
依赖安全公告
已查询这个插件声明的全部依赖,没有匹配到已公开的安全公告。(含 DSH 框架包在内的 @deepseek-ai/* 不作查询——那是运行时自己的问题,不是插件的。)