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dsh-bio-genie

github.com/moonbowterfly/dsh-bio-genie

v0.6.47 技能包 可执行外部程序写入文件发起网络请求

生物信息学「许愿式分析」插件:Python 执行器(bio_python:Biopython 全功能 + 出版级绘图)+ 57 个高频语义化工具(差异表达/GSEA、代谢建模/FBA、合成生物学设计、CRISPR、ML、文献检索、Addgene 质粒库、UniProt、单细胞 QC 等)+ 50 个 skill(1 主 skill + 17 领域配方 + 19 协议 + 5 研究方法 + 8 agent 指南)+ 零依赖自举 Python 环境(uv+venv 自动下载到插件私有目录)。用户下载安装即可许

该插件尚未翻译,显示作者原文。

dshdeepseek-harnessdsh-pluginbioinformaticsbiologybio-analysisbiology-analysisbiopython
分类
skill
发布
2026-10-07
版本
v0.6.47

检测报告

关注度高。命中了不少能力模式,其中可能有需要留意的。逐条看下面的清单。
1高关注3需留意4一般16未命中
高关注需留意一般

能力清单

  • 可执行外部程序spawns-processes高关注3 处命中
    • src/python.js:12import { spawn } from 'node:child_process'
    • src/runtime.js:18import { spawn, spawnSync } from 'node:child_process'
    • src/server.js:23import { spawn } from 'node:child_process'
    • 看它调用哪些程序。调用本机已有的工具是常见做法。
  • 写入文件writes-files需留意31 处命中
    • scripts/install-preset.js:51mkdirSync(dst, { recursive: true })
    • scripts/install-preset.js:69copyFileSync(s, d)
    • scripts/install-preset.js:105mkdirSync(targetRoot, { recursive: true })
    • src/log.js:54unlinkSync(p)
    • 看写入位置。写自己的配置目录是正常的,写系统目录不是。
  • 发起网络请求network需留意9 处命中
    • lib/client.js:23* - 浏览器 fetch('/api/dsh-bio-genie/<endpoint>') 同源调宿主侧 server.js 注册的路由
    • lib/client.js:195return fetch(RPC_PREFIX + path, {
    • lib/client.js:583return fetch(RPC_PREFIX + path, {
    • lib/client.js:3217? (sizeMismatch ? ('图片尺寸与 manifest/hitmap 不配对(实际 ' + fmtAny(sizeMismatch.got.w) + 'x' + fmtAny(sizeMismatch.got.h) + ',期…
    • 看请求发往哪些域名。发往作者自己的后端是常见做法。
  • R013 清单可疑manifest-obfuscation需留意1 处命中
    • 安装脚本: postinstall
    • 清单被刻意写乱时,加载行为会难以预测。看原文而不是看渲染结果。
  • 读取文件reads-files一般63 处命中
    • src/domain-adapter.js:126const readPkg = (p) => JSON.parse(readFileSync(p, 'utf8'))
    • src/domain-overview.js:11const HOST_VERSION = JSON.parse(readFileSync(new URL('../package.json', import.meta.url), 'utf8')).version
    • scripts/install-preset.js:52for (const entry of readdirSync(src, { withFileTypes: true })) {
    • scripts/install-preset.js:60if (existsSync(d) && skipExisting) {
    • 读文件是绝大多数插件的正常工作方式,本身不构成顾虑。
  • 读取环境变量reads-env一般25 处命中
    • scripts/install-preset.js:34if (process.env.DSH_HOME && process.env.DSH_HOME.length > 0) return process.env.DSH_HOME
    • scripts/install-preset.js:36const userHome = process.env.USERPROFILE || process.env.HOME || homedir()
    • src/python.js:22const dshHome = process.env.DSH_HOME ?? join(homedir(), '.dsh')
    • src/python.js:38env: { ...process.env, PYTHONPATH: '', PYTHONHOME: '', DSH_BIO_FIGORIGIN: figoriginMode() },
    • 环境变量里常混有密钥。看它是否把整个 env 都读走。
  • 接触凭据或密钥credentials一般10 处命中
    • lib/client.js:197credentials: 'same-origin',
    • lib/client.js:585credentials: 'same-origin',
    • src/domain-adapter.js:34'gem_secretion', 'gem_double_knockout', 'gem_enrichment', 'gem_targets', 'gem_precursor_scan',
    • …e/skills/dsh-bio-genie-expert.md:143| 必需基因全扫 / 通量区间(硬结论 vs 伪影)/ 鲁棒性 / 双敲 SL / 分泌谱 / 富集 / 靶点导出 | `gem_essentiality` / `gem_fluxscan` / `gem_sensitivity` / `g…
    • 看它读取哪些凭据、发往哪里。用于登录自己的服务是正常的。
  • 动态加载模块dynamic-import一般8 处命中
    • README.en.md:303node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"
    • README.md:344node --input-type=module -e "import('./src/runtime.js').then(m => m.ensureEnvironment({}))"
    • python/bio_ops.py:33from synbio_tools import (op_primer3_design, op_dna_optimize, op_clone_simulate,
    • python/bio_ops.py:42from analysis_ext import (op_seq_introns, op_seq_dotplot, op_uniprot,
    • 动态导入本身无害,但会让依赖关系难以静态审阅。
逐条扫描明细
能力标识关注度命中次数
可执行外部程序spawns-processes高关注3
写入文件writes-files需留意31
发起网络请求network需留意9
R013 清单可疑manifest-obfuscation需留意1
读取文件reads-files一般63
读取环境变量reads-env一般25
接触凭据或密钥credentials一般10
动态加载模块dynamic-import一般8

这份报告的口径

扫描读的是包里的源码,全程不执行第三方代码。 本次读了 137 个文件,扫描于 2026-10-14。 命中次数只说明源码里出现过这类调用,不说明行为好坏——一个插件读写文件 500 次和 1 次 都会被记为「读取文件」。这是能力清单,不是信任评分,也不是安全结论: 没扫出来的能力可能只是写法没被规则覆盖。

依赖安全公告

已查询这个插件声明的全部依赖,没有匹配到已公开的安全公告。(含 DSH 框架包在内的 @deepseek-ai/* 不作查询——那是运行时自己的问题,不是插件的。)

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